Na području koje teritorijalno pokriva Medžlis IZ Bratunac nalaze se velike površine vakufskih parcela. Međutim, evidentno je da je u gradskom i prigradskom dijelu u toku ratnih i postratnih dešavanja uzurpiran veliki broj vakufskih parcela koje još uvijek nisu vraćene. U kontekstu zaštite vakufske imovine direktor Vakufske direkcije dr. Senaid Zajimović i pravnik Huso Salihović su 04.11.2014. godine boravili u radnoj posjeti Medžlisu IZ Bratunac te sa glavnim imamom Elvirom ef. Hodžićem i predsjednikom Medžlisa Admirom ef. Velićem razgovarali o ovoj problematici. Općina Bratunac je 1997. godine bespravno oduzela vakufsku parcelu i dodijelila istu velikom broju porodica srpske nacionalnosti koji su na toj parceli izgradili porodične kuće. Medžlis IZ Bratunac je sve ove godine nastojao rješiti ovaj problem, međutim spriječen je putem raznih opstrukcija od strane lokalne zajednice i rukovodstva općine Bratunac.
Obzirom na obim uzurpacije i važnost rješavanja ovog problema Vakufska direkcija i Medžlis IZ Bratunac će u narednom periodu zajednički poduzeti niz pravnih radnji koji za cilj imaju rješavanje ove problematike. U toku radnog sastanka predstavnici Vakufske direkcije i Medžlisa IZ Bratunac razgovarali su i o popisu i uknjižbi vakufske imovine, aktualnim projektima Medžlisa te o afirmaciji vakufa na ovom području. Medžlis IZ Bratunac je uradio dosta posla na afirmaciji vakufa te njegovom unapređenju. Uz gradsku džamiju u Bratuncu formiraju jedan značajan kompleks koji u sebi ima sve potrebne kapacitete za obavljanje vjerskog, kulturnog i ekonomskog života. Medžlis IZ Bratunac je obnovio sve vjerske objekte i izgradio više nego što ih je bilo, vodi brigu o povratnicima, te daje nesumnljivo najveći doprinos opstanku Bošnjaka na ovim područjima. Vakufska direkcija će u narednom periodu Medžlisu IZ Bratunac pružati još snažniju podršku u realizaciji aktivnosti koje Medžlis sprovodi na svom području.